Genes in Contigs: Chromosome II

Genes represented on the linkage map are shown in bold.

Genomic data from The Broad Institute (http://www.broad.mit.edu/annotation/fungi/aspergillus/)
Telomere positions from Li, W., Rehmeyer, C.J., Staben, C. & Farman, M.L. (ref 1088).

Chromosome	Contig	Supercontig	Gene/ element	Autocalled gene (or position)
IIL	134	11	Telomere T6	-
IIL	135	11	cipB	AN7895.3
IIL	135	11	cipC	AN7937.3
IIL	135	11	hk2	AN7945.3
IIL	135	11	eglC	AN7950.3
IIL	135	11	furG	AN7955.3
IIL	135	11	pepJ	AN7962.3
IIL	136	11	-	-
IIL	232 +	11	-	-
IIL	137	11	-	-
IIL	193 +	11	-	-
IIL	138	11	dewA	AN8006.3
IIL	139	11	vmaA	AN8021.3
IIL	139	11	vpsA	AN8023.3
IIL	139	11	gpdA	AN8041.3
IIL	139	11	hdaA	AN8042.3
IIL	139	11	cysB	AN8057.3
IIL	139	11	phacA	AN8070.4
IIL	139	11	phacA	AN8078.3
IIL	139	11	tRNA-met	(269608-270081)
IIL	139	11	adH	AN8121.3
IIL	139	11	faoA	AN8123.3
IIL	139	11	sfgA	AN8129.3
IIL	215 +	11	-	-
IIL	140	11	-	-
IIL	203 +	11	-	-
IIL	141	11	tRNA-asp	(109277-110235)
IIL	141	11	nmrA	AN8168.3
IIL	141	11	aspC	AN8182.3
IIL	190 +	11	-	-
IIL	142	11	-	-
IIL	143	11	wA	AN8209.3
IIL	144	11	metA	AN8215.3
IIL	144	11	swoH	AN8216.3
IIL	144	11	SAM decarboxylase	AN8231.3
IIL	229 -	11	-	-
IIL	145	11	chiA	AN8241.3
IIL	145	11	snaD	AN8244.3
IIL	145	11	hapX	AN8251.3
IIL	145	11	gprF	(71025-72232)
IIL	145	11	hstA	AN11067.3
IIL	145	11	phoA	AN8261.3
IIL	145	11	gprH	AN8262.3 (opposite orientation!)
IIL	145	11	palcA	AN8271.3
IIL	145	11	citA	AN8275.3
IIL	145	11	cysD	AN8277.3
IIL	145	11	cyp51B	AN8283.3
IIL	145	11	kipA	AN8286.3
II	-	Centromere
IIR	71	4	-	-
IIR	174 +	4	-	-
IIR	70	4	chkB	AN4279.3
IIR	69	4	nsdC	AN4263.3
IIR	69	4	hxkC	AN4255.3
IIR	68	4	rmtA	AN10526.3
IIR	68	4	schA	AN4238.3
IIR	68	4	riboE	AN4231.3
IIR	68	4	rpl16a	AN4202.3
IIR	68	4	grrA	AN10516.3
IIR	68	4	mkkA	AN4189.3
IIR	68	4	nimX	AN4182.3
IIR	68	4	mthA	AN10512.3
IIR	67	4	creD	AN4170.3
IIR	67	4	creC	AN4166.3
IIR	67	4	cpcB	AN4163.3
IIR	67	4	glnA	AN4159.3
IIR	67	4	furB	AN4152.3
IIR	67	4	sdeB	AN4135.3
IIR	67	4	srrC	AN4134.3
IIR	67	4	hk-8-2	AN4113.3
IIR	236 -	4	-	-
IIR	66	4	sipA	AN4066.3
IIR	66	4	rps16	AN4060.3
IIR	65	4	kapH	AN4053.4
IIR	65	4	eIF5B	AN4038.4
IIR	65	4	amdR	AN4035.3
IIR	65	4	hapC	AN4034.3
IIR	65	4	fabM	AN4000.3
IIR	65	4	hulF	AN3999.3
IIR	64	4	gmdA	AN3957.3
IIR	64	4	sldA	AN3946.3
IIR	64	4	nimT	AN3941.3
IIR	64	4	preB	AN3932.3
IIR	64	4	thiF	AN3928.3
IIR	64	4	cyaA	AN3913.3
IIR	64	4	sndA	AN3911.3
IIR	63	4	-	-
IIR	62	4	ram2	AN3867.3
IIR	62	4	puA	AN3846.3
IIR	62	4	swoF	AN3839.3
IIR	62	4	ileA	AN3830.3
IIR	62	4	ssuA	AN3829.3
IIR	191 -	4	-	-
IIR	61	4	HMGRA	AN3817.3
IIR	61	4	spaA	AN3815.3
IIR	61	4	hosA	AN3806.3
IIR	61	4	ppzA	AN3793.4
IIR	61	4	cnxE	AN3778.3
IIR	61	4	gprC	AN3765.3
IIR	61	4	hisG	AN3748.3
IIR	61	4	alcB	AN3741.3
IIR	61	4	mns1A?	AN3733.3
IIR	61	4	fksA	AN3729.3
IIR	61	4	lcbA	AN3728.3
IIR	61	4	wh11	AN3725.3
IIR	61	4	mpkB	AN3719.3
IIR	61	4	trpA	AN3695.3
IIR	61	4	srrA	AN3688.3
IIR	61	4	cpcA	AN3675.3
IIR	61	4	nimE	AN3648.3
IIR	61	4	trpD	AN3634.3
IIR	61	4	adD	AN3626.3
IIR	61	4	ygA	AN3624.3
IIR	61	4	acoB	AN3623.3
IIR	61	4	rgsB	AN3622.3
IIR	61	4	gcnE	AN3621.3
IIR	61	4	sldI	AN3619.3
IIR	61	4	tprA	AN10448.3
IIR	61	4	xlnA	AN3613.3
IIR	61	4	atrC	AN3608.3
IIR	61	4	lreB	AN3607.3
IIR	61	4	fprA	AN3598.3
IIR	61	4	acrB	AN3597.3
IIR	61	4	p50	AN3589.3
IIR	61	4	creB	AN3587.3
IIR	61	4	kpcA	AN3583.3
IIR	61	4	trxR AN3581.3
IIR	61	4	mns1C	AN3566.3
IIR	60	4	-	-
IIR	222 +	4	-	-
IIR	59	4	agdF	AN10420.3
IIR	-	4	Telomere T4	-

Chromosome II linkage map.... Linkage data for chromosome II
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